教員情報 - 福地　佐斗志

DNAを遺伝情報の貯蔵庫とすると、タンパク質は貯蔵された情報が機能する形で現れたものであり、生体内で様々な働きをする重要な分子である。これまで、タンパク質はひも状の分子が立体的折り畳まれ特有な構造（立体構造）を形作ることで機能を発揮すると考えられてきた。しかし近年、自発的には立体構造をとらない分子が、環境により様々に形を変えることで機能を発揮する例、天然変性タンパク質の存在が明らかとなってきた。天然変性タンパク質は研究の歴史も浅く、解らないことの多い領域であり、日々新しい知見が得られているエキサイティングな研究分野である。近年は、天然変性タンパク質の構造・機能・進化等を情報生物学の手法で明らかにすることをテーマに研究に取り組んでいる。

業績

■ 著書・論文歴

1.	2018	論文	Discovery of cryoprotective activity in human genome-derived intrinsically disordered proteins. Int. J. Mol. Sci. 19,pp.401 （共著）
2.	2018	論文	Large-scale aggregation analysis of eukaryotic proteins reveals an involvement of intrinsically disordered regions in protein folding. Scientific Repots. 8,pp.678 （共著）
3.	2017	論文	The disordered linker in p53 participates in nonspecific binding to and one-dimensional sliding along DNA revealed by single-molecule fluorescence measurements. Biochemistry 56,pp.4134-4144 （共著）
4.	2016	論文	Codon usage is less optimized in eukaryotic gene segments encoding intrinsically disordered regions than in those encoding structural domains. Nucleic Acids Res., doi: 10.1093/nar/gkw899 （共著）
5.	2016	論文	Multiple-localization and hub proteins. PLoS One, 11, e0156455 （共著）
6.	2015	論文	An optimized Npro-based method for the expression and purification of intrinsically disordered proteins for an NMR study. Intrinsically Disordered Protein （共著）
7.	2015	論文	Investigation of glycan evolution based on a comprehensive analysis of glycosyltransferases using phylogenetic profiling. Biophysics and Physicobiology （共著）
8.	2015	論文	Investigation of the fatty acid transporter-encoding genes SLC27A3 and SLC27A4 in Autism. Scientific Reports （共著）
9.	2014	論文	Exon resequencing of H3K9 methyltransferase complex genes, EHMT1, EHTM2 and WIZ in Japanese autism subjects. Mol. Autism （共著）
10.	2014	論文	IDEAL in 2014 illustrates interaction networks composed of intrinsically disordered proteins and their binding partners. Nucleic Acids Res. （共著）
11.	2013	論文	An assignment of intrinsically disordered regions of proteins based on NMR structures. J. Struct. Biol. （共著）
12.	2012	論文	IDEAL: Intrinsically Disordered proteins with Extensive Annotations and Literature. Nucleic Acids Res. （共著）
13.	2012	論文	Intrinsically disordered proteins in human mitochondria. Genes Cells. （共著）
14.	2012	論文	Intrinsically disordered regions have specific functions in mitochondrial and nuclear proteins. Mol. Biosyst. （共著）
15.	2011	論文	A novel RNA-recognition-motif protein is required for premeiotic G1/S-phase transition in Rice. PLoS Genet. （共著）
16.	2011	論文	Binary classification of protein molecules into intrinsically disordered and ordered segments. BMC Structural Biology （共著）
17.	2010	論文	Computational prediction of O-linked glycosylation sites that preferentially map on intrinsically disordered regions of extracellular proteins. Int. J.Mol. Sci. （共著）
18.	2009	論文	DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer. Nucleic Acids Res. （共著）
19.	2009	論文	Development of an Accurate Classification system of Proteins into Structured and Unstructured Regions that Uncovers Novel Structural Domains: Its Application to Human Transcription Factors. BMC Structural Biology （共著）
20.	2009	論文	The GTOP database in 2009: updated content and novel features to expand and deepen insights into protein structures and functions. Nucleic Acids Res. （共著）
21.	2008	論文	The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts. Nucleic Acids Res. （共著）
22.	2007	論文	Gene Cluster Analysis Method Identifies Horizontally Transferred Genes with High Reliability and Indicates that They Provide the Main Mechanism of Operon Gain in Eight Species of {gamma}-Proteobacteria. Mol. Biol. Evol. （共著）
23.	2007	論文	Protein Thermostabilization Requires a Fine-tuned Placement of Surface-charged Residues. J Biochem (Tokyo) （共著）
24.	2006	論文	Intrinsically disordered loops inserted into the structural domains of human proteins. J. Mol. Biol. （共著）
25.	2004	論文	Estimation of the number of authentic orphan genes in bacterial genomes. DNA Res. （共著）
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■ 学会発表

1.	2020/10/05	天然変性タンパク質データベースIDEAL（トーゴーの日シンポジウム2020）
2.	2019/12/06	機械学習を用いた天然変性領域中の機能部位予測　-インターフェース作成-（第42回日本分子生物学会年会）
3.	2019/12/06	磁性細菌マグネトソームタンパク質は天然変性領域は顕著に高いが、ほとんど通常のシグナル配列を持たない（第42回日本分子生物学会年会）
4.	2019/12/06	真核生物タンパク質C端には天然変性領域が増えナンセンス変異が入っても有害にならないように進化している（第42回日本分子生物学会年会　(2019)）
5.	2019/10/05	天然変性タンパク質データベースIDEAL（トーゴーの日シンポジウム2019）
6.	2019/06/25	疾患関連タンパク質の天然変性領域に見られる機能領域（第19回日本蛋白質科学会年会）
7.	2019/06/24	機械学習を用いた天然変性領域中の機能部位予測　-インターフェース作成-（第19回日本蛋白質科学会年会）
8.	2019/03/05	機械学習を用いた天然変性領域中の機能部位予測（第8回日本生物物理学会関東支部会）
9.	2019	液滴を作るタンパク質に見られる天然変性タンパク質（大阪大学タンパク質研究所セミナー「液-液層分離の新たな展開へ向けて」）
10.	2018/11/30	リン酸化酵素が認識するリン酸化サイト配列の特徴抽出（第41回日本分子生物学会年会）
11.	2018/11/30	天然変性領域の相互作用はドッキングプログラムにより予測可能か？（第41回日本分子生物学会年会）
12.	2018/11/29	機械学習を用いた天然変性領域中の機能部位予測（第41回日本分子生物学会年会）
13.	2018/11/29	哺乳類の免疫タンパク質の構造領域は天然変性領域と同程度に速やかに進化する（第41回日本分子生物学会年会）
14.	2018/10/05	天然変性タンパク質データベースIDEAL（トーゴーの日シンポジウム2018）
15.	2018/06/28	天然変性領域中に見られる相互作用部位の配列保存性について（第18回日本蛋白質科学会年会）
16.	2018/06/27	リン酸化によって誘起されるイベントのRDF記述フォーマット（第18回日本蛋白質科学会年会）
17.	2018/06/27	機械学習を用いた天然変性領域中の機能部位予測（第18回日本蛋白質科学会年会）
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■ 社会における活動

1.	2018/08	前橋工科大学子供科学教室
2.	2014	天然変性タンパク質のプロミスキャスな相互作用

■ 研究課題・受託研究・科研費

1.	2019/04～2023/03	プロテイン・キナーゼの特異的基質認識機構の解明基盤研究(C)
2.	2009/07～2014/03	タンパク質天然変性状態の情報基盤の確立と展開新学術領域研究(研究領域提案型)

■ 学歴

東京理科大学大学院理工学研究科応用生物科学専攻博士課程修了博士（理学）

■ 職歴

1.	2022/04～	前橋工科大学工学部情報・生命工学群教授
2.	2018/04～	前橋工科大学大学院工学研究科生命情報学専攻（修士課程）教授
3.	2018/04～	前橋工科大学大学院工学研究科環境・生命工学専攻（博士課程）教授
4.	2018/04～	前橋工科大学工学部生命情報学科教授
5.	2013/04～2018/03	前橋工科大学大学院工学研究科環境・生命工学専攻（博士課程）准教授
6.	2011/04～2018/03	前橋工科大学大学院工学研究科生命情報学専攻（修士課程）准教授
7.	2011/04～2018/03	前橋工科大学工学部生命情報学科准教授
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■ 学内役職・委員

2015/04/01～2019/03/31

前橋工科大学入試委員

■ 所属学会

1.		日本生物物理学会
2.		日本蛋白質科学会
3.		日本分子生物学会

その他

■ ホームページ

タンパク質情報学研究室